Aastail 1965–75 teenis Rein Kursi koguduses ja 1976–96 Harju-Jaani Ristija Johannese koguduses. Hooldajaõpetajana on ta teeninud ka Laiuse ja Jõelähtme kogudust. Aastail 1982–96 oli Rein Ida-Harju praostkonna praost. 1996. aastast kuni 2016. aasta 21. juulini, oma 90. sünnipäevani teenis õpetaja Rein Ruhnu Püha Magdaleena kogudust.

Harry-Johannes Rein on pälvinud EELK aukirja (2006), EELK teeneteristi II järgu (2006); Valgetähe IV klassi teenetemärgi (2001), Raasiku valla aukodaniku tiitli (2007) ja Saare maavalitsuse teeneteplaadi (2013). Eelmise aasta nelipühal tunnustas EELK õpetaja Reinu elutööpreemiaga.