Rotaviirusnakkuse vastu saab vaktsineerida kuue esimese elukuu jooksul. Lapsi vaktsineeritakse kolmes etapis, 2, 3 ja 4,5 kuu vanuselt. Vaktsiin on suukaudne ning seega on vaktsineerimine väga lihtne. Vaktsineerimine aitab vältida rasket mao-soolepõletikku, vähendab haiglaravi ning võimalikke surmajuhte. Samuti aitab see ära hoida rotaviirusnakkuse puhanguid lastehoidudes ja -sõimedes.

Väikelastel kulgeb rotaviirusnakkus raskelt ja ägedalt, eriti esmasel haigestumisel. Nakkus levib väga kergesti ning enamik lastest põeb seda haigust esimeste eluaastate jooksul. Kõige sagedamini haigestuvad 6-24 kuu vanused lapsed. Haigus algab palaviku, oksendamise ja vesise kõhulahtisusega ning kiiresti võib kujuneda elule ohtlik vedelikuvaegus. Rotaviirusnakkuse puhul on tegemist kõige sagedasema väikelaste hospitaliseerimist vajava vaktsiin-välditava haigusega Eestis.