Püha Birgitta ordu põhimõtteid ja sisekorda järginud klooster asutati 1407. aastal. Aastal 2000. sai arhitektuuribüroo Luhse & Tuhal poolt projekteeritud hoone nurgakivi ning aasta hiljem toimus juba hoone sisseõnnistamine. Praegusel ajal elab Pirita kloostris kaheksa nunna, kes on sündinud Mehhikos ja Indias.

Kloostri preestrina teenib prelaat Vello Salo