Ettevõtte pankroti vahetuks põhjuseks olid suured võlad, kõneluste luhtumine võlausaldajatega ning Briti valitsuse seisukoht, et reisifirmat maksumaksja raha eest päästma ei hakata.

Taustal leiduvad aga maailmas aset leidnud muutused, millega 178 aastat tegutsenud, pikkade traditsioonidega firma ei saanud sammu pidada. Briti ajakirjanduse andmeil mõjutasid Thomas Cooki nii interneti võidukäik, kliimamuutus kui ka eelseisva Brexiti toodud segadused.