Tuule Liinid on välja käinud mitu neile arusaamatut ja kahtlusi tekitavat asjaolu. Ettevõte kahtlustab, et neile esitas sadamateenuse pakkuja Saarte Liinid tulevase võimaliku lepingu sõlmimiseks karmimad nõudmised kui teistele. Põhjuseks tõsiasi, et kunagi oli Tuule Liinide omanik Vjatšeslav Leedo, kellega seotud ettevõtteid peab Saarte Liinid enda suurvõlglaseks.