Mahepõllumajanduse meetmel on kavandatud kaks alameedet:
- Mahepõllumajandusele ülemineku toetus – mahetoetuse esmakordsetele taotlejatele kahel esimesel üleminekuaastal (tingimusel, et üleminekut mahepõllumajanduslikule tootmisele alustatakse samaaegselt nii põllumajandusmaal kui ka kõigi loomarühmadega);
- Mahepõllumajandusega jätkamise toetus – taotlejatele, kelle ettevõte on mahepõllumajanduse seaduse alusel tunnustatud ning üleminekuaeg on läbitud.

Toetust saavad taotleda mahepõllumajanduse seaduse alusel tunnustatud juriidilised isikud või füüsilisest isikust ettevõtjad, kes on aktiivsed põllumajandustootjad. Taotlejad võtavad mahepõllumajandusega tegelemiseks 5-aastase kohustuse.

Mahepõllumajanduse toetusi saab tänavu taotleda Põllumajanduse Registrite ja Informatsiooni Ameti (PRIA) kaudu 7.-25. maini.

Kokku on Eesti Maaelu arengukavas 2014-2020 meetmele „Mahepõllumajandus“ ette nähtud 92,2 miljonit eurot. Esimeseks taotlusvooruks 2015. aastal on kavandatud 13 miljonit eurot. Mahetootjatel on võimalik saada toetust ka mitmest teisest maaelu arengukava meetmest.