Põllumajandustoetuste laiem maksustamine on põhjendatud, kuna nende maksmisega hüvitatakse põllumajandustootjatele või erametsaomanikele saamata jäävat tulu või kompenseeritakse muul moel turutõrkeid või makstakse toetust mingi tegevusega seoses.

Mitme toetuse iseloom on selline, et selle saaja peakski olema ettevõtjana registreeritud ja sellisel juhul maksustatakse toetus tulumaksuga ka kehtiva seaduse alusel muu ettevõtlustulu hulgas. Kui maksustatavaks muutuva toetuse saamisega kaasneb kulude tegemise vajadus, on toetuse saajal võimalik registreerida end füüsilisest isikust ettevõtjana ja tulu saamisega seotud kulud toetusest maha arvata.