Toetatakse mõisakoolidele suunatud tegevusi, mis aitavad kaasa mõisaansamblite mitmekülgsemale kasutamisele: arendustegevusi, mis tutvustavad ja väärtustavad ajalooliseid mõisahooneid, koolitusi, õppepäevi, laagreid, näitusi, trükiseid jms. Toetust võib taotleda ka mõisakompleksidega seotud ettevõtluse arendamiseks. Toetatakse ka muinsuskaitseliste uuringute läbiviimist, muinsuskaitse eritingimuste koostamist, hoonete restaureerimis- ja remondiprojektide koostamist teostatavusanalüüsi olemasolul ning väärtuslike hoonedetailide avariitöid.

Kultuuriministeerium toetab mõisakoole juba alates 2001. aastast, mil alustati esmakordselt riikliku programmiga. Praegu kehtiv programm on koostatud aastateks 2012–2016.